Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP36Q9P275 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP36Q9P275 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP36Q9P275 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP36Q9P275 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP36Q9P275 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms