Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PRO2289Q9P1D8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PRO2289Q9P1D8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PRO2289Q9P1D8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PRO2289Q9P1D8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PRO2289Q9P1D8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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