Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM9Q9P0T7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM9Q9P0T7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM9Q9P0T7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM9Q9P0T7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms