Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC15Q9P013 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CWC15Q9P013 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC15Q9P013 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC15Q9P013 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CWC15Q9P013 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CWC15Q9P013 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC15Q9P013 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CWC15Q9P013 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC15Q9P013 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC15Q9P013 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC15Q9P013 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC15Q9P013 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC15Q9P013 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC15Q9P013 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC15Q9P013 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms