Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MIS18AQ9NYP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MIS18AQ9NYP9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MIS18AQ9NYP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MIS18AQ9NYP9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MIS18AQ9NYP9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MIS18AQ9NYP9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MIS18AQ9NYP9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MIS18AQ9NYP9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms