Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSD3Q9NYI0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSD3Q9NYI0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSD3Q9NYI0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSD3Q9NYI0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSD3Q9NYI0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms