Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNK4Q9NYG8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNK4Q9NYG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNK4Q9NYG8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNK4Q9NYG8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms