Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GOLGA6AQ9NYA3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA6AQ9NYA3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6AQ9NYA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6AQ9NYA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms