Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN3BQ9NY72 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN3BQ9NY72 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN3BQ9NY72 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN3BQ9NY72 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN3BQ9NY72 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms