Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.116e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-217ENST00000529133 593 ntTSL 513.79□□□□□ -0.26e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 213.65□□□□□ -0.226e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 413.53□□□□□ -0.246e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TALDO1-205ENST00000530440 710 ntTSL 313.36□□□□□ -0.276e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-221ENST00000531068 496 ntTSL 413.36□□□□□ -0.276e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-218ENST00000530442 577 ntTSL 213.3□□□□□ -0.286e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 513.15□□□□□ -0.36e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-210ENST00000527699 564 ntTSL 312.2□□□□□ -0.466e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.56e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 LINC01344-203ENST00000608183 2631 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.146e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 27.78□□□□□ -1.166e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.336e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.78□□□□□ -1.966e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 54.4
AATFQ9NY61 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.139e-7■■■■■ 54.4
AATFQ9NY61 RPL3-207ENST00000459859 447 ntTSL 324.18■■□□□ 1.461e-323■■■■■ 54.3
AATFQ9NY61 RPL3-218ENST00000498462 669 ntTSL 322.94■■□□□ 1.261e-323■■■■■ 54.3
AATFQ9NY61 RPL3-208ENST00000460589 630 ntTSL 220.99■□□□□ 0.951e-323■■■■■ 54.3
AATFQ9NY61 RPL3-205ENST00000427905 782 ntTSL 517.32■□□□□ 0.361e-323■■■■■ 54.3
AATFQ9NY61 RPL3-209ENST00000461967 767 ntTSL 216.05■□□□□ 0.161e-323■■■■■ 54.3
AATFQ9NY61 RPL3-217ENST00000484615 827 ntTSL 215.77■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 54.3
AATFQ9NY61 RPL3-204ENST00000420536 711 ntTSL 511.19□□□□□ -0.621e-323■■■■■ 54.3
AATFQ9NY61 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 316.74■□□□□ 0.274e-33■■■■■ 54.2
AATFQ9NY61 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.084e-33■■■■■ 54.2
AATFQ9NY61 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.051e-10■■■■■ 54
AATFQ9NY61 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.04□□□□□ -1.61e-10■■■■■ 54
AATFQ9NY61 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.561e-323■■■■■ 54
AATFQ9NY61 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-49■■■■■ 53.8
AATFQ9NY61 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 53.7
AATFQ9NY61 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 53.7
AATFQ9NY61 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 423.07■■□□□ 1.288e-7■■■■■ 53.6
AATFQ9NY61 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.158e-7■■■■■ 53.6
AATFQ9NY61 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 53.6
AATFQ9NY61 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 524.36■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 53.4
AATFQ9NY61 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 53.4
AATFQ9NY61 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 53.4
AATFQ9NY61 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 53.4
AATFQ9NY61 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 53.3
AATFQ9NY61 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 53.3
AATFQ9NY61 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 53.3
AATFQ9NY61 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 219.71■□□□□ 0.758e-7■■■■■ 53.3
AATFQ9NY61 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 53.3
AATFQ9NY61 EEF2-205ENST00000598436 549 ntTSL 215.48■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 52.9
AATFQ9NY61 CCDC91-219ENST00000544780 693 ntTSL 325.5■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-218ENST00000544649 665 ntTSL 323.13■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-205ENST00000536442 1301 ntTSL 523.04■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 520.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 AGPAT3-215ENST00000484865 588 ntTSL 214.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 212.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-206ENST00000538586 471 ntTSL 49.41□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-203ENST00000535520 1626 ntTSL 26.25□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-211ENST00000540794 518 ntTSL 33.17□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 CCDC91-204ENST00000536154 549 ntTSL 40.96□□□□□ -2.262e-6■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.387e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.517e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 311.6□□□□□ -0.557e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 210.73□□□□□ -0.697e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.847e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 39.82□□□□□ -0.847e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.83□□□□□ -1.327e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.657e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.967e-47■■■■■ 52.8
AATFQ9NY61 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.596e-16■■■■■ 52.3
AATFQ9NY61 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.626e-16■■■■■ 52.3
AATFQ9NY61 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.781e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 425.39■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 218.41■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 49.92□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-234ENST00000521791 556 ntTSL 49.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 49.31□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 58.98□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -11e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 52.1
AATFQ9NY61 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 52
AATFQ9NY61 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 52
AATFQ9NY61 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 52
AATFQ9NY61 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.381e-323■■■■■ 51.7
AATFQ9NY61 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)25.88■■□□□ 1.731e-7■■■■■ 51.5
AATFQ9NY61 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 51.5
AATFQ9NY61 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.981e-323■■■■■ 50.9
AATFQ9NY61 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 24.28□□□□□ -1.721e-323■■■■■ 50.9
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