Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC39A1Q9NY26 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A1Q9NY26 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A1Q9NY26 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms