Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALKBH4Q9NXW9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALKBH4Q9NXW9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKBH4Q9NXW9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms