Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT4Q9NX09 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDIT4Q9NX09 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT4Q9NX09 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDIT4Q9NX09 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms