Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNAU1APQ9NX07 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRNAU1APQ9NX07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRNAU1APQ9NX07 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms