Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ZDHHC8-204ENST00000436518 557 ntTSL 416.59■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SH3D21-206ENST00000508854 1134 ntTSL 510.33□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ATP9B-222ENST00000590477 1784 ntTSL 216.08■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ATP9B-219ENST00000589951 585 ntTSL 415.83■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ATP9B-216ENST00000588921 1511 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ATP9B-212ENST00000587919 509 ntTSL 37.96□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.191e-6■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 520.87■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 420.2■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 318.7■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-221ENST00000531548 554 ntTSL 417.84■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-210ENST00000527024 527 ntTSL 417.84■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-223ENST00000534485 556 ntTSL 417.12■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 214.95□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-217ENST00000529818 549 ntTSL 410.44□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-219ENST00000530801 557 ntTSL 48.67□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 AP2A2-209ENST00000526753 464 ntTSL 44.17□□□□□ -1.745e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.986e-6■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.616e-6■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-6■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.077e-7■■■■■ 29
SLTMQ9NWH9 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 316.09■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)13.7□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 320.61■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.191e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 313.58□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-214ENST00000589575 749 ntTSL 313.56□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PTBP1-213ENST00000587191 357 ntTSL 512.07□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.362e-6■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 326.34■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.9
SLTMQ9NWH9 SERPINF2-204ENST00000453066 842 ntTSL 517.97■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 28.8
SLTMQ9NWH9 SCART1-205ENST00000488261 4709 ntTSL 221.57■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 28.8
SLTMQ9NWH9 SCART1-204ENST00000482993 4904 ntTSL 221.54■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 28.8
SLTMQ9NWH9 SCART1-202ENST00000463137 4756 ntTSL 221.16■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 28.8
SLTMQ9NWH9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 28.8
SLTMQ9NWH9 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 523.31■■□□□ 1.325e-8■■■■■ 28.8
SLTMQ9NWH9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.95e-8■■■■■ 28.8
SLTMQ9NWH9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.133e-10■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.713e-10■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.283e-10■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 CSNK1E-208ENST00000431611 814 ntTSL 515.65■□□□□ 0.13e-10■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 CSNK1E-209ENST00000431632 763 ntTSL 214.86□□□□□ -0.033e-10■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-10■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 TRAPPC12-216ENST00000469400 720 ntTSL 213.15□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 GUSBP11-201ENST00000422506 2055 ntTSL 222.72■■□□□ 1.236e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 GUSBP11-205ENST00000452737 1662 ntTSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.226e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.046e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.7■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 GUSBP11-204ENST00000451837 3234 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 GUSBP11-203ENST00000445682 3350 ntTSL 215.23■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 LONP2-208ENST00000566755 2514 ntTSL 513.72□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 LONP2-202ENST00000416006 2056 ntTSL 213.01□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-211ENST00000598639 738 ntTSL 311.7□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-207ENST00000596702 538 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-209ENST00000597343 860 ntTSL 59.95□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 LONP2-206ENST00000565867 1969 ntTSL 39.93□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 RPTOR-204ENST00000572733 424 ntTSL 39.79□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-206ENST00000595798 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-205ENST00000595001 4796 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-220ENST00000640952 577 ntTSL 48.58□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-215ENST00000601249 2546 ntTSL 1 (best)7.73□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-212ENST00000598723 565 ntTSL 46.39□□□□□ -1.396e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 ZNF611-217ENST00000601643 531 ntTSL 45.16□□□□□ -1.586e-7■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 28.7
SLTMQ9NWH9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 28.7
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