Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PANK4Q9NVE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PANK4Q9NVE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PANK4Q9NVE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PANK4Q9NVE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PANK4Q9NVE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms