Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM39AQ9NV64 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM39AQ9NV64 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39AQ9NV64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39AQ9NV64 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM39AQ9NV64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39AQ9NV64 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM39AQ9NV64 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM39AQ9NV64 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM39AQ9NV64 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMEM39AQ9NV64 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms