Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TDP1Q9NUW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDP1Q9NUW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TDP1Q9NUW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDP1Q9NUW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDP1Q9NUW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDP1Q9NUW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TDP1Q9NUW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDP1Q9NUW8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDP1Q9NUW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDP1Q9NUW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
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