Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A13Q9NSD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A13Q9NSD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A13Q9NSD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A13Q9NSD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A13Q9NSD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms