Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGEF3Q9NR81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGEF3Q9NR81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ARHGEF3Q9NR81 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms