Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL4Q9NR61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL4Q9NR61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLL4Q9NR61 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DLL4Q9NR61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms