Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ6

ZC4H2, Zinc finger C4H2 domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC4H2Q9NQZ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZC4H2Q9NQZ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZC4H2Q9NQZ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC4H2Q9NQZ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC4H2Q9NQZ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC4H2Q9NQZ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms