Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM8Q9NQV8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM8Q9NQV8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM8Q9NQV8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms