Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECTIN3Q9NQS3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NECTIN3Q9NQS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN3Q9NQS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms