Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTN4Q9NQC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN4Q9NQC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN4Q9NQC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RTN4Q9NQC3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN4Q9NQC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms