Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C12orf4Q9NQ89 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C12orf4Q9NQ89 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C12orf4Q9NQ89 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C12orf4Q9NQ89 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf4Q9NQ89 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf4Q9NQ89 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf4Q9NQ89 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf4Q9NQ89 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C12orf4Q9NQ89 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf4Q9NQ89 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms