Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCUBE2Q9NQ36 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCUBE2Q9NQ36 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCUBE2Q9NQ36 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms