Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF12AQ9NP84 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF12AQ9NP84 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF12AQ9NP84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF12AQ9NP84 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms