Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD248Q9HCU0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CD248Q9HCU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD248Q9HCU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD248Q9HCU0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CD248Q9HCU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD248Q9HCU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms