Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC24A3Q9HC58 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC24A3Q9HC58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC24A3Q9HC58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC24A3Q9HC58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms