Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBX8Q9HC52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX8Q9HC52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX8Q9HC52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX8Q9HC52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX8Q9HC52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms