Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NANOGQ9H9S0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGQ9H9S0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NANOGQ9H9S0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NANOGQ9H9S0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms