Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPS7BQ9H9Q2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPS7BQ9H9Q2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPS7BQ9H9Q2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPS7BQ9H9Q2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPS7BQ9H9Q2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms