Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SCAF1Q9H7N4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SCAF1Q9H7N4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SCAF1Q9H7N4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SCAF1Q9H7N4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
SCAF1Q9H7N4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms