Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RETREG1Q9H6L5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RETREG1Q9H6L5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RETREG1Q9H6L5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RETREG1Q9H6L5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms