Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX17Q9H6I2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX17Q9H6I2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms