Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB1Q9H4B7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB1Q9H4B7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB1Q9H4B7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB1Q9H4B7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms