Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA4AQ9H3S1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4AQ9H3S1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4AQ9H3S1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEMA4AQ9H3S1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA4AQ9H3S1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms