Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00597Q9H2U6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00597Q9H2U6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00597Q9H2U6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC00597Q9H2U6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00597Q9H2U6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms