Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIOBPQ9H2D6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIOBPQ9H2D6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIOBPQ9H2D6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIOBPQ9H2D6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIOBPQ9H2D6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIOBPQ9H2D6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms