Protein–RNA interactions for Protein: Q9H251

CDH23, Cadherin-23, humanhuman

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23Q9H251 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH23Q9H251 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH23Q9H251 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDH23Q9H251 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDH23Q9H251 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDH23Q9H251 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDH23Q9H251 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH23Q9H251 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH23Q9H251 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH23Q9H251 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH23Q9H251 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH23Q9H251 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDH23Q9H251 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH23Q9H251 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDH23Q9H251 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDH23Q9H251 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH23Q9H251 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDH23Q9H251 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH23Q9H251 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH23Q9H251 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms