Protein–RNA interactions for Protein: Q9H172

ABCG4, ATP-binding cassette sub-family G member 4, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG4Q9H172 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG4Q9H172 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG4Q9H172 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG4Q9H172 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms