Protein–RNA interactions for Protein: Q9H172

ABCG4, ATP-binding cassette sub-family G member 4, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG4Q9H172 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG4Q9H172 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG4Q9H172 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG4Q9H172 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG4Q9H172 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG4Q9H172 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG4Q9H172 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCG4Q9H172 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms