Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN2Q9H000 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN2Q9H000 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN2Q9H000 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN2Q9H000 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2Q9H000 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms