Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTDSP1Q9GZU7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSP1Q9GZU7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSP1Q9GZU7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms