Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM31Q9BZY9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM31Q9BZY9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM31Q9BZY9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM31Q9BZY9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM31Q9BZY9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms