Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTPBP4Q9BZE4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTPBP4Q9BZE4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GTPBP4Q9BZE4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms