Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUSAP1Q9BXS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUSAP1Q9BXS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUSAP1Q9BXS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUSAP1Q9BXS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUSAP1Q9BXS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUSAP1Q9BXS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms