Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM109Q9BVC6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM109Q9BVC6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM109Q9BVC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM109Q9BVC6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms