Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP8Q9BV40 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAMP8Q9BV40 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms