Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC28BQ9BUN5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC28BQ9BUN5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC28BQ9BUN5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC28BQ9BUN5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC28BQ9BUN5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms